「いろいろと決済に問題がある」ということですが、日本のデビットカードやプリペイドカードに共有する問題、「二重引き落とし」のことでしょうかね?
クレジットカードのシステムをそのまま準用してデビットカードやプリペイドカードを運営した結果、この辺の問題は生じるようになったと言えますが。
通販サイトではデビットやプリペイドの利用を控えてくれ、とお願いする所もいくつか私は確認しています。実際に使えなくしてあるところもあるでしょう(二重引き落とし&返金までに日数を要する・・・の問題から客とトラブルが発生した事例もいくつかあると聞きます).。
両者とも発行する会社が増えてきている以上、この問題は今後さらに拡大していく可能性がありそうですが。